基因研究，我該拿你怎么辦？

發(fā)布時間： 2021-09-01　　點擊次數(shù)： 1780次

有時候小伙伴們拿到一個 Gene-A，可能是芯片篩查的結(jié)果，可能是導(dǎo)師拍腦袋的結(jié)果，這個 A 很低調(diào)，被人研究的頗少，作為一個基礎(chǔ)研究的新手，簡直一頭霧水！

凡是都有規(guī)律可循。如果你文獻看的沒有那么多，腦洞未開，下面的保守方法可以適合你進行初步的嘗試。但是要提醒小伙伴們不時的追蹤一下文獻研究進展，更多的時候不是為了知道某個分子或者某個領(lǐng)域研究的最新情況，這些對于基層科研人員的意義并不是很大；而是為了發(fā)散自己的思維，提煉別人的研究設(shè)計思路！

下面這幾步，對于剛剛上手實驗的小伙伴來說，應(yīng)該有所幫助。

1.確定 A 研究的價值，即臨床組織樣本/相關(guān)細(xì)胞系中有沒有差異性表達

腫瘤組織樣本	→ ↘	分析A在臨床組織中的表達是否與腫瘤進展程度或者例如大小、轉(zhuǎn)移灶、預(yù)后等相關(guān)
	→ ↘
腫瘤細(xì)胞系	→	分析A在臨床癌組織、腫瘤細(xì)胞系中的表達對比癌旁組織和正常細(xì)胞系是否差異表達

2. 確定 A 能夠?qū)δ骋患?xì)胞表型產(chǎn)生一定的影響

shRNA慢病毒干擾載體	↘ → → ↗	可能用到的載體手段	敲除/過表達A	↗ → → → ↘	細(xì)胞增殖
過表達載體					細(xì)胞凋亡
突變載體					細(xì)胞周期
敲除載體					細(xì)胞運動
					細(xì)胞侵襲

3. 確定 A 能夠?qū)π∈蟮哪[瘤形成的作用是否與上一步較為一致。

選擇動物模型進行功能驗證，一般選擇裸鼠進行成瘤實驗

裸鼠種植瘤需注意：

●腫瘤細(xì)胞的狀態(tài)

●細(xì)胞的數(shù)量：每只注射2×106－107

●裸鼠的選擇：5-8周齡

●種植部位：血供豐富區(qū)域，如腋窩中后部、腹股溝中上部。

4. 找出 A 的作用機制

Microarray/pathway array/相關(guān)芯片分析A影響下游基因的mRNA/通路/蛋白表達變化

qRT-PRC、Western blot 驗證

驗證A調(diào)控B/C/D的特異性

▍

結(jié)合增殖、周期、凋亡、遷移和侵襲等表型

另外還可以同步研究一下 A 本身是否受到甲基化或者乙酰化等表觀遺傳調(diào)控。

這樣是否簡單易懂呢？小伙伴們不妨針對自己的某基因研究，做出一個類似的技術(shù)路線圖，做完一步劃掉一步。那些表型也不是都做的，要看文獻或者自己分析一下你研究的基因 A 是否跟一些例如增殖相關(guān)基因或者周期相關(guān)基因等有聯(lián)系，或者涉及到某些明星通路等。

以上為常規(guī)手段，可為基礎(chǔ)薄弱的小伙伴尋求大方向。如果想要高大上的研究設(shè)計，每步還請自行查閱文獻加以創(chuàng)新。

下一篇：【科研熱點】腫瘤中的miRNA（二）

上一篇：【技術(shù)】教你如何達到提取RNA的最高境界！

產(chǎn)品中心 Products

基因研究，我該拿你怎么辦？

基因研究，我該拿你怎么辦？